根据《消防法》和相关消防安全技术规范，消防安全巡查应检查疏散通道是否畅通（A）、消防设施是否完好有效（B）、灭火器是否在有效期内（D）以及消防控制室值班人员是否在岗（E）。选项C（员工是否佩戴安全帽）属于施工现场的安全管理范畴，不直接属于消防安全巡查的重点内容。