应急照明与疏散指示系统的配置原则包括：系统必须满足人员迅速疏散需求（A）；疏散指示标志应具备自发光或持续供电的特性（C），以确保在断电情况下仍能清晰指示逃生路线；系统应具备自动切换至应急电源的功能（E），保障火灾时的持续供电。选项B错误，因为自然光源不可靠，不能作为主要应急照明方式；选项D不符合现行标准中规定应急照明照度一般不低于正常照明的1/2的要求。