自动灭火系统若未定期维护检查，可能无法在火灾发生时正常启动，导致隐患；喷头未按规定间距布置会影响灭火效果；补水系统压力不足会影响系统供水能力；安装时未符合设计要求可能导致系统效能降低。而防火分区未设置独立控制装置属于可能影响系统分区控制的问题，通常应用于整体系统设计，而非喷淋系统本身。因此，A、C、D、E是正确答案。